Em um futuro próximo, Thomas Anderson (Keanu Reeves), um jovem programador que vive isolado em um cubículo escuro, é atormentado por pesadelos inquietantes. Neles, ele se vê conectado por cabos a um vasto sistema computacional do futuro, contra sua vontade. Em todas essas situações, acorda gritando exatamente no momento em que eletrodos estão prestes a penetrar seu cérebro. Conforme esses sonhos se repetem, Anderson começa a questionar a natureza da realidade. Após encontrar os enigmáticos Morpheus (Laurence Fishburne) e Trinity (Carrie-Anne Moss), Thomas descobre que, como muitas outras pessoas, é refém do Matrix — um sistema artificial e inteligente que controla a mente humana, criando a ilusão de um mundo real enquanto utiliza os corpos e cérebros das pessoas como fonte de energia. Morpheus, por sua vez, acredita firmemente que Thomas é Neo, o messias esperado que tem o poder de desafiar o Matrix e libertar a humanidade da ilusão, guiando-a de volta à verdadeira realidade e liberdade.
