Peter (Levi Miller) é um garoto de 12 anos que vive em um orfanato de Londres durante a Segunda Guerra Mundial. Certo dia, ele e várias outras crianças são capturados por piratas a bordo de um navio voador, que logo passa a ser perseguido por caças do exército britânico. Conseguindo escapar, o navio segue rumo à Terra do Nunca, um lugar mágico e distante onde o capitão Barba Negra (Hugh Jackman) mantém crianças e adultos em cativeiro para extrair pixum, uma pedra preciosa que contém pó de fada. Durante a dura rotina de mineração, Peter conhece James Hook (Garreth Hedlund), que planeja uma fuga desse lugar.
